В годы Второй мировой войны (1941-1945) «Хлебозавод Московского района» (именно так он тогда назывался), завод выпускал хлеб для жителей осажденного города и оборонявшей его армии. После войны коллективу завода было вручено на вечное хранение переходящее Знамя Комитета Обороны. В 1948 г.на предприятии начался выпуск пряников. В 50х – 60х годах завод претерпел значительные технические изменения, и его производственная мощность выросла до 440 т хлеба, 45 тонн пряников, 9 тонн макаронных изделий, 6 тонн сдобных изделий в сутки.
90-е годы стали отправной точкой для больших изменений, повлиявших на дальнейшее развитие завода. Предприятие было преобразовано в Акционерное Общество и вскоре переименовано в ОАО «Хлебный Дом». В 1995 году проведена первая открытая эмиссия акций, и началась реконструкция производства, в ходе которой были заменены 4 основные технологические линии по производству хлеба и батонов.
В 1997 году компания начала свое сотрудничество с группой «Фацер». В 1998 году был введен в эксплуатацию цех по выработке сдобы, и открылся фирменный магазин «Хлебный Дом» на Московском пр., 208. На следующий год «Хлебный Дом» был признан «Лучшим предприятием пищевой промышленности Санкт-Петербурга».
2000 год был богат на разные события - проведена реконструкция экспедиции, образован собственный автопарк для своевременной доставки продукции, установлена автоматизированная линия мойки и подачи чистой тары на производство, установлена современная система очистки воды, используемой для производства хлебобулочных изделий. Начато производство пряников с начинкой «Летний Сад» и порционного хлеба «Краюшки».
В период с 2002 по 2003 год произошло объединение с Муринским и Василеостровским хлебозаводами и начинается их реконструкции и модернизация. «Хлебный Дом» начинает выпуск новой продукции - «Ягодные лукошки».
2004-2005 - годы активного расширения продаж в России. Начинается производство порционного хлеба «Лицейский» и формового хлеба «Геркулес». Запуск трех новых производственных линий выводит на рынок дополнительные продуктовые бренды: лаваш «Ладушки», «Бабушкин Хлеб», серия булочек «Успешки».
Компании вручается Главная общественная премия страны - Российский национальный Олимп.